小叶紫檀心材浅红、黄色、红褐色，久则转深，带紫，较小叶紫檀虽然有些相像但是发糠偏柴色。
虽然小叶红檀和小叶紫檀一样，都为散孔材，但是其管孔在放大镜下明显，且略小，所以宏观上小叶红檀叫小叶紫檀来讲，无明显棕眼表现。
小叶红檀和小叶紫檀都有轴向薄壁组织，但是小叶红檀轴向薄壁组织肉眼下明显，发达，傍管带状（间距小）和轮界状（波浪形），看上去有很明显的鸡翅木的纹路。
小叶红檀和小叶紫檀浸泡在酒精的反应是不同的，酒精浸泡小叶红檀后，颜色呈蓝色或浅蓝色。
现在总结一下小叶红檀和小叶紫檀的异同：小叶红檀心材新切面橘红色，久转为深紫色，有一股酸香气，酷似紫檀，但其纹理粗，弦切面上带状条纹明显且宽，管孔形成的牛毛纹长、直、粗、多，显得木材比小叶紫檀木粗糙。
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