哲学与宗教一样，也是由中国传入日本。
佛教在传入中国600年后东传日本，而中国的哲学则以宋朝理学的东渡开创了日本文明的更生期。
1）藤原惺窝（Fujiwara Seigwa）：因不满做一个僧侣所能获取的学问，醉心于中国圣贤才识，准备远涉重洋前往中国学习。
然而1552年以来，日本已禁止国人与中国交往。
藤原惺窝准备偷渡。
恰巧在登轮前夕，他在所住的旅馆中听到一位书生在朗读儒家著作——宋朝朱熹注释的《大学》，狂喜，于是他放弃了中国之行，开始收集宋朝哲学的典籍，潜心研究，终成一代大师。
2）林罗山（Hayashi Razan）：藤原惺窝学生。
本来德川家康想用重金聘请藤原惺窝到京都解说孔孟之道。
但藤原惺窝恃才傲物，派林罗山过去，自己则继续进修。
不过林罗山不负师望，表现突出，后来他的名望和影响力都在藤原惺窝之上。
3）室久操（Muro Kyuso）：醉心研究儒教。
他的座右铭如下：我将每晨6时起床，及至每夜12时休息。
除非宾客来访、疼痛或其他不可避免的情况下，我绝不偷懒……我绝不说谎。
我不说废话，即使是对卑贱人。
我将节制饮食。
倘若有邪念，我将立即节制，绝不让其滋长。
思想犹豫势必降低读书效率，我应该集中精神，避免草率。
我应克制自己，修养自己，绝不允许名利欲望妨害内心安宁。
4）贝原益轩：出自医生世家的哲学家。
他对神学的观念几乎与孔子一样抱着“敬鬼神而远之”的态度，认为宇宙是深不可测的，唯有愚人在做坏事之际，才会假借祷告来求取上帝的谅解，以获取心灵的慰藉。
他更认为哲学是融合经验与智慧、欲望与德性所作的一种努力。
对他而言，德性的修养远比学问的追求来得重要。
学习的目的，不仅是在于获得广博的知识，更重要在于修养品性。
道德上的完人比饱学之士对社会有益，这也是教育的目标。
“孩子们，不要对老人的话感到厌烦；当父母、祖父母对你们谆谆教诲时，且勿掉头就走或视为耳边风。
或许你们会认为传统过于迂腐，可是那是祖先智慧的结晶，不可毫不顾虑地粉碎它。
”世上绝无两个相同的景致。
人生来去如同流水；惟明月与天地同在。
5）中江藤树（Nakaye Toju, 1608-1648年）：阳明哲学6）伊藤仁斋（Ito Jinsai）和荻生徂（cu）徕（lai）（Ogyu Sorai）：研究孔子言行【小故事】伊藤仁斋晚年贫困，甚至过年都没有做年糕的米，但他坦然处之。
他妻子在此困境下向他倾诉：“尽管环境困苦，我还能安贫乐道，唯有一点让我难以忍受，那就是我们的孩子因为不了解贫困处境，对邻居小孩的年糕常起嫉妒之心，虽然我批评了小孩，但我的内心无比辛酸。
”伊藤仁斋并没有回答，继续看他的书。
随后，他又脱下了暗红色的戒指交给她妻子说：“把它卖掉，买些年糕给小孩吃。
”伊藤东涯（Ito Togai）：伊藤仁斋儿子。
“人死后很快就被遗忘，但有些人为求死后留名，著书立说以便流传千古，这实在是一种错误，因为到头来流传千古者有几人呢？”在他有生之年，著作繁多计达242卷，但在242卷里从未对其他哲学家有中伤之言。
他不道人之短荻生徂（cu）徕（lai）“日本人包括我自己都可以说野蛮人，只有中国人才够资格说是文明人；而所有真理名言，都早已经被孔子以及儒家诸贤所道破。
”7）贺茂真渊与本居宣长：放弃学习中国的一切，鼓吹日本较其他国家更优越【补充】传说曾有一位武士，因为获得一把新刀，于是伺机在日本桥（Nihon Bashi，即江户的中央桥）附近试刀，恰巧有一农夫喝得大醉蹒跚而来，武士持刀当头一劈直下脚心，而醉汉尚能往前走，直到触及一位苦力时，身子才分成两半倒卧下来。
奇怪的是，进食米、鱼而不吃肉类的苦力，能够再一天中奔跑15到18英里而无倦容，一旦品尝肉类，即丧失此等能力。
哲学家贝原益（Kaibara Ekken）也曾建议说，如果妻子为喋喋不休的长舌妇，夫可休妻；相反，如果丈夫放荡、野蛮，则为人妻者更应该温顺体贴。
就在这种长期严厉的教养下，日本妇女遂成为最勤勉、最忠贞、最服从的妻子，并且使欧美游客感到惊讶与惋惜，为何这样美好的制度，不能在欧美国家被采用。
《源氏物语》为日本最有名的小说《枕草子》作者清少纳言