共同点：企业的固定基金和专用基金都是净资产类科目。
两者的不同点，主要是基金核算的内容有区别： （一）固定基金 １.固定基金核算事业单位因购入、自制、调入、融资租入（有所有权的）、接受捐赠以及盘盈固定资产所形成的基金。
２.新建、购入固定资产时，借记有关支出科目，贷记“银行存款”等科目，同 时借记“固定资产”科目，贷记本科目。
融资租入固定资产，按实际支付的租金，借 记有关支出科目，贷记本科目。
接受捐赠的固定资产，借记“固定资产”科目，贷记 本科目。
盘盈的固定资产，按重置完全价值借记“固定资产”科目，贷记本科目；盘 亏的固定资产，按账面原价借记本科目，贷记“固定资产”科目。
出售、对外投资转 出固定资产，借记本科目，贷记有关科目。
（二）专用基金　 １.专用基金核算事业单位按规定提取，设置的有专门用途的资金的收入、支出及结存情况。
２.事业单位专用基金的种类主要包括：职工福利基金、医疗基金、修购基金、住房基金等。
３.提取医疗基金时，借记“事业支出－－社会保障费”、“经营支出－－社会 保障费”等科目，贷记“专用基金－－医疗基金”科目。
提取修购基金时，借记“事 业支出－－修缮费、设备购置费”或“经营支出－－修缮费、设备购置费”科目，贷 记专用“专用基金－－修购基金”科目；清理报废固定资产残值变价收入转入时，借记“银行存款”科目，贷记本科目；支付清理报废固定资产所发生的清理费用时，借记本科目，贷记“银行存款”科目。
年终，事业单位按规定比例从当年结余詈提职工福利基金时，借记“结余分配－－职工福利基金”等科目，贷记本科目。
事业单位收到各项住房基金收入（不包括个人缴纳的住房公积金）时，借记“银行存款”科目，贷记“专用基金－－住房基金”科目。
对于个人住房公积金缴存情况，单位应设置辅助账进行登记并核算其缴纳、使用及余存情况。
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