二元八运与三元九运元運之説、飞星派和大掛派都是用三元九運、即上中下三元、ー元六十年、一元中又分三運、毎運二十年。
而兩元八運、元分上下兩元、上元包含一ニ三四運、下元則是六七八九運。
元運在應用上、通常是與八卦及九星數結合起來討論的、于是就會出現一個問題，即卦与數相配落在九宮方位上會出現五在中宮無卦可配的情形。
为了處理这個情况、在三元九運的理論中，因为每運都是二十年、所以就把五運的那二十年均分为二，前面十年归于四運，並以四運所配的卦來一體適用，後面十年則归于六運，也是以六運所配的卦來一體適用。
所以嚴格說來，中元四五六運這六十年在寶際運用上變成是四運的三十年加上六運的三十年所組成的。
兩元八運理論在處理五入中宮無卦可配的情況時，是直接把五運拿掉，剩下八個運分成ーニ三四運为一組，屬於上元,六七八九運將一組, 屬於下元，如此則各運均有相對應之卦與之相配。
而各運的年數，就不是 固定的二十年了，而是根据各運所配之卦,其陰陽爻的多寡來計算的，阴爻以六年計，陽爻以九年計，如此則一運坤卦有18年，二運巽卦年24年，三運離卦24年，四運兌卦24年，上元ー二三四運共90年。
而六運艮卦有21年，七運坎卦21年、八運震卦21年、九運乾卦27年，下元六七八九運也是90年，上下兩元共180年。
這與三元九運的總年數是一樣的,兩者的一運均从甲子年开始，中间历经三次六十甲子的循环，最后终止于癸亥年，总共180年元運之说的起源已經很難去探究，为何古人要這樣計算元運，簡而言之，似乎與六十甲子紀年的規則性有關，而兩元八運之說又與易經卦理有关，据說最早的甲子年約在四千多年前,古人觀察到天上出現「五星連珠」即金木水火士五顆行星排成一直線的現象、也有一說是说天上出現 （七政齊一）即五顆行星再加上太陽、月亮二星，排列成一直线的天文現象，于是就把該年定为第一個甲子年，也就是上元一運的開始，然後每二十年即換運。
故採三元九運之說的風水家們，普遍认为三元九運的原理應與天上星辰的運行周期有關。
有些研究者則指出每二十年换运的原理和土木二星交會的周期有关，因篇土木二星各自以不同的週期绕着太陽運行，恰好也是每二十年交會一次。
所以从第一次七政齊一之後，經過二十年，士本二星再度相逢，而元運也同時改換，之後毎二十年土木二星交會而同時也更換一個運数。
这个说法乍听之下似乎很有道理，但若仔細探究，則會發現其中有謬誤矛盾之处，與現代天文學所觀察到的現象是不符合的。
土木二星每二十年交會一次這一點虽然沒錯。
但其交會之年若对照六十甲子紀年，則會發現一定是在庚辰、庚子、庚申这三個年份交會，而這三個年份均非元運改換之年。
一運起於甲子年，經過二十年後，是在甲申年進入二運，再經二十年，則是在甲辰年入三運，之後又再等到下一輪的甲子年開始走四運，所以元運的替換必定在甲子、甲申、甲辰这三個年份，而此三年並非士木二星交會之年。
實際上應該是説元運更換之後要再過十六年土木二星才交會，或者說土木二星交会之後要再過四年才眞正換運。
兩元八運之说，虽不如三元九運之广为人知，但这套理論也並非近人凭空發明，而是有其源远流長的傳承和實際應用的效验，只是一直很少有人为此說述闡揚，廣篇宣傅，所以识者不多。
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