1、按照目前国家法律和政策规定，小产权房因为是集体用地，政府房管部门不会办理房产证以及土地使用证的。2、有的地方对于小产权房，可能办理所谓的“房产证”，但绝不是国家房管部门颁发的正规房证。就农村来说，大多是以“新农村建设”办理的。3、城镇有些地方的房产，可以办理正规的房产证，但不能办理土地使用证，是因为房地产开发商没有向政府缴纳土地使用费。这种房产只能办理房产证。

一、要办理《国有土地使用权证》，有如下几种情况才能办理：1、房屋本身就在国有土地上修建的；2、经过征收集体土地转为国有土地，经出让用地者取得国有土地使用权。二、在集体土地上建筑的房屋，不能办《国有土地使用权证》，因为其土地的所有权还属于本集体经济组织，仍然属集体土地所有，不属国有土地。三、对于你说的情况，除上述情况外，请到当地国土资源局办证大厅进行咨询，工作人员会向你解释为什么不能办其《国有土地使用权证》的依据和理由的。

按如下流程办理：　　1、购房者办好房权证后，携带身份证、房产证、土地证总证复印件、合同、房屋办证的契税发票等材料原件及复印件，到土管部门申请办理土地证；　　2、开发商在出售完商品房后，把土地证总证面积根据购房者的房屋所占面积数据分割多个小证数据；土管部门工作人员受理后进入审批程序；因办房权证已经缴纳契税等费用，只需缴纳登记费（工本费）即可。

首先要搞清楚你所取得的房屋是否有国土证（总证），如果有（通常情况下有土地证才会有房产证），你可以根据国土证（总证）直接向国土部门申请分户。如果没有，那么要看该房屋是什么个情况，比如说该房屋为原来很早以前的房屋，当时只办理了房产证而没有办理土地证的，那么你现在就可以向当地国土部门申请补办土地证，并且还要补缴土地出让金，以便完善土地手续取得土地证。

1、按照目前国家法律和政策规定，小产权房因为是集体用地，政府房管部门不会办理房产证以及土地使用证的。2、有的地方对于小产权房，可能办理所谓的“房产证”，但绝不是国家房管部门颁发的正规房证。就农村来说，大多是以“新农村建设”办理的。3、城镇有些地方的房产，可以办理正规的房产证，但不能办理土地使用证，是因为房地产开发商没有向政府缴纳土地使用费。这种房产只能办理房产证。